Το αρχείο περιλαμβάνει κώδικες, φιρμάνια, πατριαρχικά γράμματα, βεράτια και διάφορα άλλα τεκμήρια που παρήχθησαν ή συγκεντρώθηκαν από τα λειτουργούντα στο πλαίσιο της οθωμανικής διοίκησης εκκλησιαστικά και κοινοτικά όργανα του ελληνορθόδοξου μιλλέτ των περιοχών της Μικράς Ασίας, του Πόντου και της Ανατολικής Θράκης.
Ο κύριος όγκος του αρχειακού υλικού αποτελείται κυρίως από κώδικες των κατά τόπους εκκλησιών και κοινοτήτων του ελληνορθόδοξου πληθυσμού, αφορούν τον 19ο αιώνα και φτάνουν έως το 1922. Το υλικό χωρίζεται, κατά κύριο λόγο, σε δύο κατηγορίες, τους κοινοτικούς και τους εκκλησιαστικούς κώδικες. Οι κοινοτικοί κώδικες περιλαμβάνουν πρακτικά συνεδριάσεων της δημογεροντίας, κανονισμούς σωματείων, πωλητήρια, δωρητήρια, συμβόλαια δασκάλων, έξοδα συντήρησης σχολείων, καταλόγους βιβλιοθηκών, πατριαρχικές εγκυκλίους κ.λπ. αλλά και πληροφορίες για δοσοληψίες με την οθωμανική εξουσία μέσω των φόρων και των απογραφών. Στους εκκλησιαστικούς κώδικες καταγράφονται έσοδα και έξοδα, βαπτίσεις, γάμοι, διαθήκες, θέματα διαχείρισης της εκκλησιαστικής και μοναστικής περιουσίας, το φιλανθρωπικό έργο αλλά και τα ιερά σκεύη και τα κτήματα των εκκλησιών και μοναστηριών ενόψει της ανταλλαγής πληθυσμών.
Στο αρχείο εκτός από τους κώδικες διασώζονται φιρμάνια, βεράτια και πατριαρχικά γράμματα κυρίως από τις περιοχές της Καππαδοκίας, του Πόντου, της Κιλικίας, της Ανατολικής Θράκης και της Βιθυνίας που αποτυπώνουν το πλαίσιο των σχέσεων των κοινοτικών και εκκλησιαστικών οργάνων του ελληνορθόδοξου μιλλέτ με την οθωμανική διοίκηση και το Οικουμενικό Πατριαρχείο.

Έγγραφα από το αρχείο του πρώην Μητροπολίτη Ελευθερουπόλεως Σωφρόνιου (Σταμούλη), αλληλογραφία και άλλα στοιχεία του Θρακικού Κέντρου, του Οικουμενικού Πατριαρχείου και διάφορα έγγραφα που αφορούν την Ανατολική Θράκη και την Κωνσταντινούπολη, κυρίως, του πρώτου μισού του 20ού αιώνα.

Κ85β:

1. Εννιά (9) επιστολές του Οικουμενικού Πατριαρχείου (1918-1923).
2. Έξι (6) επιστολές της Αρχιγραμματείας και Υπογραμματείας της Ι. Συνόδου Κωνσταντινουπόλεως και τρεις (3) εγκύκλιοι.
3. Μία (1) επιστολή του Πατριάρχη Αντιόχειας Γρηγορίου.
4. Δύο (2) ισολογισμοί κοινοτήτων Μυριοφύτου.
5. Πέντε (5) Δελτία του Γραφείου Τύπου της Γενικής Διοίκησης Θράκης 1922.
6. Μία (1) εγκύκλιος του Αναπληρωτή Γενικού Διοικητή Θράκης Δεκάζου και
7. Δεκατέσσερα (14) αποτυπώματα σφραγίδων Μητροπόλεων και Σωματείων της Ανατολικής Θράκης.

Κ85γ:

1. Εικοσιεννιά (29) γράμματα Πατριαρχών, τοποτηρητών και προέδρων συλλόγων (1914-1926).
2. Εννιά (9) Εγκύκλιοι Πατριαρχείων (1919-1943).
3. Επτά (7) διάφορα έγγραφα εκκλησιαστικά (1911-1924).
4. Έξι (6) έγγραφα Ύπατης Αρμοστείας Κωνσταντινουπόλεως (1920).
   5.Εικοσιπέντε (25) έγγραφα Γενικής Διοικήσεως Θράκης και υπηρεσιών (1922-1923).
5. Τρία (3) έγγραφα κυβερνητικά (1932-1933).
6. Τέσσερα (4) διπλώματα συλλόγων (1892, 1919, 1927).
7. Τρία (3) έγγραφα σχετικά με τοπωνυμίες Ανατολικής Θράκης.
8. Πρακτικά συσκέψεων Βουλευτών Προσφύγων Θράκης (1929).
9. Έξι (6) έγγραφα Θρακικής Ενώσεως Κωνσταντινούπολης (1919-1920).
10. Έξι έγγραφα (6) Μητροπόλεως Μυριοφύτου.
11. Δύο (2) στατιστικά περιοχής Μυριοφύτου (1913-1923).
12. Δεκαέξι (16) δελτία Τύπου Γενικής Διοίκησης Θράκης (1920-1922).
13. Τέσσερα (4) διάφορα έγγραφα.
14. Δεκαέξι (16) αποτυπώματα σφραγίδων και δεκατέσσερα (14) αποκόμματα εντίτλων εγγράφων διαφόρων υπηρεσιών.

Κ85δ:

1. Είκοσι (20) γράμματα Οικουμενικών Πατριαρχών, τοποτηρητών, κ.λπ (1912-1931).
2. Ένα (1) έγγραφο του Πατριάρχη Αντιόχειας Γρηγορίου (1923).
   3.Οκτώ (8) έγγραφα Κεντρικής Επιτροπής Μετατοπισθέντων Πληθυσμών (1919).
3. Έξι (6) επιδοτήρια και προικοσύμφωνα (1919-1920).
4. Δύο (2) έγγραφα της Θρακικής Ένωσης Κωνσταντινουπόλεως (1919).
5. Τρεις (3) εγκύκλιοι Πατριαρχείων (1911-1921).
6. Επτά (7) έγγραφα σχετικά με τους διωγμούς του ελληνικού πληθυσμού στην Οθωμανική Αυτοκρατορία (1914).
7. Πέντε (5) Δελτία Τύπου (1921).
8. Δώδεκα (12) έγγραφα της Πολιτικής Διοικήσεως Θράκης (1921).
9. Τρία (3) έγγραφα υπουργείων (1924-1930).
10. Πέντε (5) καταστάσεις συμβολαίων κ.ά. Μυριοφύτου (1921-1924).
11. Δεκατρία (13) έγγραφα της Υποδιοικήσεως Μυριοφύτου (1920-1922).
    13.Δύο (2) έγγραφα της Διοικήσεως Ραιδεστού (1920).
12. Οκτώ (8) διάφορα έγγραφα της Μητροπόλεως Μυριοφύτου (1913-1920).
13. Μία (1) εγκύκλιος του Διοικητή 13ου Συντάγματος (1921).
14. Ένα (1) Φιρμάνι ιδρύσεως Σχολής Πλατάνων (Μυριοφύτου) (1911).
15. Έξι (6) ενδεικτικά σπουδών της Μεγάλης του Γένους Σχολής (1888-1889).
16. Ένα (1) αντίγραφο διαθήκης του Θεμ. Γρηγορίου (1854).
17. Ένα (1) δίπλωμα Αδελφότητας Αγ. Ιωάννου Περιστάσεως (1919).
18. Οκτώ (8) επιστολές διαφόρων (1912-1922).
19. Δέκα (10) αποδείξεις πληρωμών σωματείων, κ.λπ. (1911-1917).
20. Εννιά (9) έγγραφα Αρχιγένειων Καθιδρυμάτων Επιβατών (1911-1912).
21. Ένα (1) έγγραφο της Επιτροπής προς ανέγερσιν σχολής εν Χαλκηδόνι (1920).
22. Ένα (1) έντυπο "Πασχάλιοις Πίναξ Πατριαρχείων" (1928).
23. Τέσσερα (4) διπλώματα διαφόρων εταιρειών (1895-1920),
24. Ένα (1) έντυπο "Πρόγραμμα Εθνικού Συνδέσμου Κωνσταντινουπόλεως" (1919).
25. Τρία (3) αποτυπώματα σφραγίδων.

Κ85ε:
Φ. Ι:

1. Εννιά (9) γράμματα Πατριαρχικά και Τοποτηρητών (1919-1930).
2. Ένα (1) έγγραφο της Κεντρικής Επιτροπής Μεταναστεύσεως Πληθυσμών (1919).
3. Πέντε (5) έγγραφα Αρμοστειών και Γενικής Διοικήσεως Θράκης (1921-1923).
4. Δύο (2) έγγραφα Θρακικής Ενώσεως (1919).
5. Δύο (2) Πατριαρχικοί Εγκύκλιοι (1914, 1919).
6. Έντεκα (11) εικόνες.
7. Δύο (2) έγγραφα Υποδιοικήσεως Μυριοφύτου (1920, 1923).
   Φ. ΙΙ:
8. Επιστολές προς τον Μητροπολίτη Σωφρόνιο (Ν. Καζάζη, Π. Παπαγεωργίου, Σ. Λάμπρου, Α. Κουρτίδου, Γερμ. Στρινοπούλου, κ.ά.).
9. Δώδεκα (12) αποδείξεις Σωματείων.
10. Μία (1) Κεντρ. Επιτρ. Ζαγορισίου (1919).
    Φ. ΙΙΙ. Διάφορα στατιστικά επαρχίας Μυριοφύτου και Περιστάσεως.
    Φ. IV: Διάφορα διωγμών πληθυσμών Θράκης (1919-1923)
    Φ. V: Διακόσιες τριάντα τρεις (233) επιστολές Φ. Αποστολίδη, Γ. Βαλέτα, Ν. Βασιλειάδη, Κ. Βουτσόπουλου, Αθηνάς Γαϊτάνου Γιαννιού, Απ. Δοξιάδη, Λ. Εννάλη, Δ. Καμπούρογλου, Κορυτσάς Ευλογίου Κουρίλα, Κ. Κουρτίδη, Γ. Μπακαλάκη, Πολ. Παπαχριστοδούλου, Παντοκρατορινού Αθαν. Αρχιμανδρίτη, Σ. Παπαδοπούλου, Παραμυθίας Αθηναγόρου, Δ. Πασχάλη, Μεγ. Πρωτοσυγκέλλου Αδαμάντιου, Ν. Ροδοπούλου, Αχ. Σαμοθράκη, Έκτορος Σαραφίδου, Ι. Σπαθάρη, Τραπεζούντος Χρύσανθου, Τρωάδος Ευσταθίου, Μέν. Φιλήντα, βιογραφία Ξενοκράτους, Μ. Γεδεών.